El diseño de la sede incorpora características japonesas, como un techo inspirado en origami o papiroflexia, un arte que consiste en el plegado de papel sin usar tijeras.

Después de Tokio 2020 el Centro Acuático se convertirá en la base de la natación japonesa. También funcionará como una instalación de natación habilitado para todos, desde los niños hasta los adultos mayores, para practicar deporte y mejorar su salud y bienestar.

Con los Juegos de Tokio 2020 aplazados hasta julio de 2021, el gobierno metropolitano de Tokio decidió abrir el centro para uso privado y para que las federaciones deportivas la utilicen para realizar competencias y entrenamientos, como primera medida del legado de los Juegos.

Las pruebas de natación comenzarán en la primera semana de los Juegos Olímpicos Tokio 2020, y hasta el momento, Argentina cuenta con tres clasificados: Delfina Pignatiello, Julia Sebastián y Santiago Grassi.